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Universal Multiplexable matK Primers for DNA Barcoding of Angiosperms

机译:用于被子植物DNA条形码的通用可复用matK引物

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摘要

Premise of the study: PCR amplification of the matK barcoding region is often difficult when dealing with multiple angiosperm families. We developed a primer cocktail to amplify this region efficiently across angiosperm diversity.Methods and Results: We developed 14 matK primers (seven forward, seven reverse) for multiplex PCR, using sequences available in GenBank for 178 taxa belonging to 123 genera in 41 families and 18 orders. Universality of these new multiplexed primers was tested with 53 specimens from 44 representative angiosperm families in 23 different orders. Our primers showed high PCR amplification and sequencing success.Conclusions: These results show that our newly developed primers are highly effective for multiplex PCR and can be employed in future barcode projects involving taxonomically diverse samples across angiosperms. Using multiplex primers for barcoding will reduce the cost and time needed for PCR amplification.
机译:研究的前提:处理多个被子植物家族时,通常很难扩增matK条码区域的PCR扩增。我们开发了一种引物混合物,可在被子植物多样性中有效地扩增该区域。方法和结果:我们使用GenBank中178个分类单元(属于41个家族的123个属)的序列开发了14个matK引物(七个正向,七个反向)用于多重PCR。 18个订单。这些新的多重引物的通用性用来自23个不同订单的44个代表性被子植物家族的53个标本进行了测试。结论:这些结果表明,我们最新开发的引物对多重PCR非常有效,可用于将来涉及被子植物分类学分类样品的条形码项目。使用多重引物进行条形码编码将减少PCR扩增所需的成本和时间。

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